Tendances ornithologiques du Québec, 2.0 !
Je viens tout juste de mettre en ligne les rapports des observations 2022-2023, pour les clubs de la province, à l’endroit habituel (Tendances Ornithologiques du Québec). Vous pourrez y découvrir et comparer les efforts des ornithologues dans chaque club, et bien sûr voir les faits saillants ornithologiques de l’hiver. Ces rapports se veulent un complément, pas un substitut, au portail eBird de la province.
Depuis 2010, ça fait beaucoup de rapports - 4 saisons x 28 clubs et régions x 13 ans ~ près de 1500 rapports ! Devant cette accumulation, j’ai décidé de créer un nouvel outil qui sera plus complet et flexible, vous permettant de générer des rapports sur mesure pour la période de votre choix. J’espère que l’outil sera publiquement accessible d’ici l’été 2023 - il est en période de test actuellement et si vous voulez l’explorer, suffit de m’envoyer un courriel et je vous fournirai un lien.
TOQ v2 c’est quoi?
Le nouveau Tendances Ornithologiques du Québec (TOQ) aura une facture visuelle similaire à l’ancien, mais plutôt que vous offrir une longue liste d’années et de saisons pour sélectionner un rapport, vous serez invités à choisir un club et vos dates (début et fin). Avec ce choix, l’outil fera l’extraction de données et vous permettra d’explorer les statistiques d’observations pour votre club et période sélectionnés: tableaux de l’effort d’observation par mois pour les protocoles eBird, les nombres de listes, de km, d’heures, d’espèces, etc. Comme avant, vous aurez aussi un tableau palmarès des observateurs et des sites, ainsi que les tendances dans l’effort d’observation depuis 1970 dans votre club. Mais, fini les saisons délimitées de manière rigide - si c’est la semaine de pâques seulement qui vous intéresse, ainsi soit-il!
Pour les oiseaux, vous aurez un tableau général présentant les nombres de mentions, la première, la dernière, le maximum, pour votre sélection de dates. Vous pourrez sélectionner une espèce (ou hybride, etc.) ce qui vous permettra d’avoir sa carte de répartition (comme dans le portail eBird) mais aussi la date de la première mention, les nombres par liste, les records pour le club, avec les liens menant à la liste eBird concernée.
Parmi les nouveautés, vous verrez la tendance de l’espèce pour le club et les dates sélectionnées. Par exemple, voici la tendance du Grand Pic dans le club des ornithologues de Québec, juste pour les dates s’échelonnant entre le 13 février et le 25 mai:
On voit tout de suite un bug - les mois en anglais... j’y travaille ! Mais avec cet outil, quelqu’un pourra non seulement avoir la tendance générale (annuelle) de l’espèce mais aussi la tendance pour une saison précise. Comme vous voyez dans la figure (bouton en bas à gauche), il sera possible d’exporter le graphique - ainsi que tous les tableaux générés, en format texte, Excel ou PDF.
La version 2.0 sera donc plus complète et flexible que le concept original des rapports saisonniers. Avantage significatif: contrairement à la version actuelle de TOQ, tous les rapports seront assemblés avec la dernière mise à jour des données eBird. Dans la version originale de TOQ, une fois publiés, les rapports n’intègrent pas les modifications subséquentes dans la base de données eBird.
Pour les geeks
TOQ v.2 est hébergé sur un nuage de serveurs de la compagnie Posit, propriétaire du logiciel RStudio, une interface de programmation en R, C++, Python, etc. J’ai utilisé un module de programmation R appelé Shiny pour créer TOQ v.2 et le publier sur les serveurs. Le regroupement QuébecOiseaux défraie gracieusement les coûts d’hébergement, et dans le forfait actuel il est possible d’avoir une dizaine d’utilisateurs en même temps et 8 Go de mémoire vive. Est-ce que cela suffira?
Perspectives
Le défi actuel est la consommation de mémoire pour faire rouler cet outil. Alors que dans TOQ v.1 les rapports étaient statiques1, ici ils sont dynamiques, en ce sens que tous les calculs sont faits en temps réel à partir des données brutes d’eBird. Vous sélectionnez le Club de l’Outaouais? TOQ doit aller chercher les listes eBird entrant dans le périmètre géographique du club, puis en extraire les sommaires demandés. Quand les nombres de listes sont dans les centaines de milliers, voire les millions, ça fait beaucoup de calcul. J’espère juste que les serveurs de TOQ v.2 pourront résister à l’afflux des ornithologues-détectives lors des longues soirées d’hiver.
Dans un avenir plus éloigné, j’espère offrir aux utilisateurs la possibilité d’utiliser un secteur de leur choix, par exemple un cercle d’un rayon de X kilomètres centré sur leur domicile, ou un polygone quelconque. Avec cela, fini la contrainte d’eBird de n’avoir que des statistiques de “hotspots” ! Mais c’est pas pour demain car j’espère avoir un outil bien rodé pour passer à une éventuelle version 3.
En attendant TOQ v.2, je vous invite encore une fois à explorer la nouvelle cuvée re rapports pour l’hiver 2022-2023, et bien sûr à profiter des temps plus cléments pour documenter l’arrivée de nos premiers migrateurs!
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Commentaires importés de WordPress
Robert Allie 21 mars 2023
Bonjour André,
Merci pour tout ce travail que vous effectuez pour les ornithologues du Québec.
J’ai bien hâte de consulter la version 2.0…
Concernant les éventuels cercles «par exemple un cercle d’un rayon de X kilomètres» de la futur version 3, les cercles des RON seraient certainement appréciés.
Bravo!
A+
André Savary 21 mars 2023
Tout simplement fantastique! Très intéressant, permet de comparer le nombre d’espèces, le nombre d’oiseaux, d’observations et d’observateurs années après années!
Nathalie Gendron 6 juillet 2023
Bonjour André,
Cet outil est très intéressant, mais je dois dire que j’ai vraiment hâte de voir la V2. J’ai justement besoin de connaître la tendance du CABR et du HACO dans les Laurentides. Je comprends que j’aurais ma réponse avec cette nouvelle version.
Merci pour ce beau travail!
André Desrochers 7 juillet 2023
@Nathalie – éventuellement! Mais faudra d’abord lancer officiellement TOQ 2.0, ce qui devrait se faire début septembre.
Notes de bas de page
Statiques en ce sens que les clics de l’utilisateurs n’appelaient que du contenu fixé (excepté les tableaux). Avec TOQ v2, un clic peut générer une opération comme la production d’un graphique, la modélisation d’une courbe, le calcul d’une moyenne, etc.↩︎